元明清时期，随着经济，文化的进步，医药学有了新的发展。药酒在整理前人经验，创制新配方，发展配制法等方面都取得了新的成就，使药酒的制备，达到了更高的水平。这一时期，我国已积累了大量医学文献，前人的宝贵经验受到了元明清时期医家的普遍重视，因而，在元明清时期，出版了不少著作，为整理前人的经验做出了重要的贡献。 《饮膳正要》是我国的部营养学专著。共三卷。天历三年（1330年）刊。忽思慧为蒙古族营养学家，任宫廷饮膳太医时，将累朝亲侍进用奇珍异馔，汤膏煎造，及诸家本草，名医方术，并日所必用谷肉果菜，取其性味补益者，集成一书。书中关于饮酒避忌的内容，是很有道理的。具有重要的价值。书中的一些补酒，虽没有详细记载，但都是颇为有效的，在《本草纲目》中则有详细记载。 明代医学家李时珍写成了举世闻名的名著《本草纲目》，共五十二卷，万历六年（1578年）成书。该书集明及历代我国学，植物学之大成，广泛涉及食品学，营养学，化学等学科。该书在收集附方时，收集了大量前人和当代人的药酒配方。卷25酒条下，设有“附诸药酒方”的专目，他本着“辑其简要者以备参考。多者，不能尽录”的原则，辑药酒69种。除此之外，《本草纲目》在各药条目的附方中，也往往附有药酒配方，内容丰富，据有人统计《本草纲目》中共计药酒方约为200多种。这些配方极大多数是便方，具有用药少，简便易行的特点。 《遵生八笺》是明代高濂所著的养生食疗专著，共十九卷，约成书于万历十九年（1591年）全书40多万字，分为八笺，以却病延年为中心，涉及医药气功，饮馔食疗，文学艺术等。其中的《饮馔服食笺》共有三卷，收酿造类内容17条。酿造类中的碧香酒，地黄酒，羊羔酒等，均为宋代以来的名酒。其中一些是极有价值的滋补酒。此外在《遵生八笺》中的《灵秘丹药笺》中还有30多种药酒。 《随息居饮食谱》是清代王孟英所编撰的一部食疗名著，共一卷。咸丰十一年（1861年）刊行。书中的烧酒条下附有7种保健药酒的配方，制法和。这些药酒大多以烧酒为酒基。与明代以前的药酒以黄酒为酒基有明显的区别。以烧酒为酒基，可增加药中有效成分的溶解。这是近现代以来，药酒及滋补酒类制造上的一大特点。明代朱檐等人的《普济方》，方贤的《良方》，王肯堂的《证治准绳》等著作中辑录了大量前人的药酒配方。 明清时期也是药酒新配方不断涌现的时期。明代吴旻的《扶寿精方》，龚庭贤的《万病回春，《寿世保元》，清代孙伟的《良朋汇集经验神方》，陶承熹的《惠直堂经验方》，项友清的《同寿录》，王孟英的《随息居饮食谱》等都记载着不少时清时期出现的新方。

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