1.果皮的组织中含许多螯形化合物作用强烈的植酸。植酸和矿物质结合成为植酸盐，植酸会阻碍矿物质的吸收。 　　2.种皮中含有大量的蜡脂和色素，对人体健康会有不利。 3.由于糙米保留了外层(果皮、种皮、珠心保护层)保护组织，其农药含量会比精米高出许多，甚至上百倍，以至于坊间有所谓糙米的产生，强调栽种过程杜绝使用农药。但是所使用的农家肥里面也会有一定量的曽药残留，况且水源、空气的流动都在所难免会有微量的化学残留。如砷、镉、汞、铅等重金属农药在食品、绿色食品的相关标准中都必须有限量残留指标，砷的、绿色标准大米我们国家限量是0.4 Mg/kg，铅是0.2 Mg/kg，镉是0.1 Mg/kg，汞是0.01 Mg/kg等等数十项指标规定，这些农残的含量，糙米要比精米高出数十倍，甚至数百倍，所以食用糙米食品对人类健康也有很大的不利因素。例如：黑龙江省五常产的一种食品稻谷，其糙米镉含量为0.28 Mg/kg，而其精米含量为0.0051 Mg/kg，相差54倍之多。

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